Die Ortsgemeinde besitzt grosse Landflächen. Die rund 90 Hektaren landwirtschaftliche Nutzfläche, davon etwa 16 Hektaren in Höchst, werden fast ausschliesslich an 9 Vollerwerbsbetriebe verpachtet.
Diese nutzen den Boden um Gemüse, Kartoffeln, Ribelmais, Getreide, Obst und Wein zu produzieren. Zudem hat auch die Milch-, Fleisch- und Futterproduktion eine grosse Bedeutung. So wird als Spezialität in St. Margrethen in bedeutendem Umfang auch Schafmilch produziert.
St. Margrethen besitzt eine vielfältige Nahrungsmittelproduktion, die eine wichtige Rolle in der regionalen Nahversorgung spielt. Die Ortsgemeinde St. Margrethen ist Partner der regionalen Landwirtschaft. Mit langfristigen, berechenbaren Pachtverhältnissen zu günstigen Konditionen schafft sie gute Rahmenbedingungen für die Betriebe
